Pola aliran air atau sistem hidrologi menunjukkan arah aliran yang masing- masing menuju ke sungai sungai utama yang melintasi dan di sekitar wilayah Kota Banjar. Batas area tangkapan (catchment area) antara sistem hidrologi tersebut adalah gugusan punggungan perbukitan dan khususnya di tepi Sungai Citanduy ada yang dibatasi oleh tanggul Sungai Citanduy. Secara umum penjelasan cakupan area masing- masing sistem tersebut dapat dijelaskan sebagai berikut:
- Sistem Citanduy adalah sistem hidrologi yang menuju langsung ke Sungai Citanduy. Area dari sistem ini mencakup: sebelah barat Kecamatan Purwaharja dan yang dibatasi oleh tanggul Sungai Citanduy, sebagian besar Kecamatan Banjar di bagian utara, sebagian kecil Kecamatan Pataruman bagian barat dan yang dibatasi oleh tanggul Sungai Citanduy, serta sebagian kecil Kecamatan Langensari yang dibatasi oleh tanggul Sungai Citanduy.
- Sistem Cijolang adalah sistem hidrologi yang menuju ke Sungai Cijolang melalui Sungai Citapen dan yang dibatasi oleh tanggul Sungai Cijolang. Area dari sistem ini mencakup: sebagian timur dan utara Kecamatan
- Sistem Ciseel – Cikembang – Cimaragas adalah sistem hidrologi yang menuju langsung ke Sungai Ciseel – Cikembang – Cimaragas di sebelah selatan. Area dari sistem ini mencakup: sebagian kecil Kecamatan Banjar bagian selatan (sebagian Kelurahan Situbatu dan Neglasari) dan sebagian kecil Kecamatan Pataruman bagian selatan (sebagian Desa Binangun dan Desa Batulawang).
- Sistem Cilisung adalah sistem hidrologi yang menuju ke Sungai Cilisung dan selanjutnya menuju ke Ciseel/Citanduy bagian hilir yang sudah di luar wilayah Kota Area dari sistem ini mencakup: sebagian besar Kecamatan Langensari dan sebagian Kecamatan Pataruman sebelah timur.